重庆动物园按动物分类形成儿童游乐区、鸟禽区、中心休闲区、灵长类区、猛禽区、草食动物区、科普区、后山休闲区8个功能分区。建有11座猛禽场馆。公园中建有儿童乐园、旱冰场、露天舞台、阅览室、餐馆、茶园等。重庆动物园有动物馆20多处，饲养动物240余种，4200余只，其中珍稀动物有大熊猫、小熊猫、扭角羚、盘羊、华南虎、云豹、金猫、亚洲象等。
1、熊猫馆
重庆动物园是全国最早的大熊猫、小熊猫繁殖基地之一。熊猫馆占地1.1万平方米，分为上熊猫馆和下熊猫馆。熊猫卧室多在石洞内，管内饲养展出大熊猫8只，川星、新星、亮亮、兰香、二顺、娅娅、友友、莽仔。
2、食草动物区
食草动物区现饲养展出动物26种，共分为大象馆、长劲鹿馆、袋鼠苑、斑马房、河马馆、犀牛馆、扭角羚馆、羚羊馆、鹿苑九个展区。
3、猛兽区
猛兽不全都是食肉动物，包括老虎、非洲狮、豹子等肉食性动物，也包括猴类、猩猩、棕熊等杂食动物。重庆动物园猛兽区现饲养展出动物56种，300余只，分为虎山、狮馆、猩猩馆、可爱动物区、熊山、猴馆、综合兽馆等十个分区。极具特色的虎山位于园内中心地带，虎山现饲养展出华南虎、东北虎和孟加拉白虎。
4、鸟语林
鸟语林展出国内外各种鸟类1000多种10000多只，其中有来自美洲、澳洲、非洲、东南亚的珍惜鸟类动物30余种200余只，有鹦鹉家族中个头最大的紫蓝金色鹦鹉、美丽的火烈鸟、澳洲最大的鸸鹋、黑天鹅等，是集鸟类保护、人鸟同乐、科普知识宣传、休闲娱乐为一体的全国最大的生态型鸟语林。
5、两栖爬行馆
两栖爬行馆饲养展出动物71种，这里饲养有叫声如婴儿的娃娃鱼，有让人毛骨悚然的各种蛇，有珍贵的鳄鱼，还有大型绿海龟，以及形态各异的热带鱼和金鱼。
6、金鱼馆
别致的设计、精巧的布局、秀美的景观，使整个庭院清雅静幽，这里现在有30多种金鱼。
7、儿童科普乐园
游乐设施共13项，有惊险刺激的激流勇进、海盗船；有童趣无穷的碰碰车、豪华转马、花果山漂流；有参与性强的激战鲨鱼岛、5D7D、太空漫步；有妙趣横生的小火车、迷你穿梭、自控飞机。
